O programa Futuras Cientistas conta com diversas parcerias com unidades de pesquisa em todo o Brasil.
REGIÃO NORTE
Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia
Secretaria de Estado do Meio Ambiente do Amapá
Fundação Oswaldo Cruz Escritório de Rondônia
REGIÃO NORDESTE
Instituto Nacional do Semiárido
Instituto Federal de Pernanbuco
Centro Regional de Ciências Nucleares do Nordeste
REGIÃO CENTRO-OESTE
Instituto Brasileiro de Informação em Ciência e Tecnologia – IBICT – IBICT
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico – CNPq
Consulado Geral dos EUA em Recife
REGIÃO SUDESTE
Instituto Nacional de Tecnologia
Museu de Astronomia e Ciências Afins
Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais
Instituto de Química da Universidade de São Paulo
Centro Aprendiz de Pesquisador
Laboratorio Nacional de Luz Síncrotron
Centro Nacional de Monitoramento e Alerta de Desastres Naturais